曾任职于中国(海南)改革发展研究院、海南新能源股份有限公司，现任广西银河集团有限公司董事长、总裁，兼任北海银河高科技产业股份有限公司董事长。

1982年至1986年曾在南京大学经济系学习。(也有资料显示1993年进入南京大学学习，1988年毕业)

1988年7月，潘琦从南京大学硕士毕业，随后就读于西南财经大学。

1991年7月获博士学位。

1992年1月到海南发展，任职于中国(海南)改革发展研究院，

次年3月任职于海南新能源股份有限公司。

1992年12月，29岁的潘琦到广西北海创业，成立北海通台经济发展总公司，自任董事长。

1993年6月，北海通台经济发展总公司等五家单位共同发起成立北海银河高科技产业股份有限公司(G银河)，潘琦任该公司董事长(一直至2006年1月)。

1993年6月，北海银河高科技产业股份有限公司(银河科技)成立，潘琦任董事长。

1998年4月，银河科技在深交所挂牌。

2000年9月，潘琦在南宁注册成立广西银威特投资管理公司;

2002年9月，广西银威特更名为广西银河投资管理有限公司;

2002年10月，银河投资又更名为广西银河集团有限公司。

2002年8月，潘琦主导银河集团开始新一轮的扩张。经过半年多的谈判，银河集团与G银河控股的北海银河科技(资讯 行情 论坛)电气有限责任公司，

2002年11月25日，银河集团受让北海通台持有的银河科技8.86%的股权成为第一大股东。

2003年3月10日，银河集团与银河科技控股的北海银河科技电气有限责任公司，分别受让遵义市国有资产投资经营有限公司持有的长征电器27%和22.19%的股权，成为长征电器第一、第二大股东 21cbr

2003年3月10日分别受让遵义市国有资产投资经营有限公司持有的G长征27%和22.19%的股权，成为G长征的第一、第二大股东。2004年4月，潘琦就任G长征董事长。

2004年1月12日，银河集团增持银河科技股权至21.4%。

2005年10月又增持至22.81%。

2005年4月，潘琦辞去长征电器董事长一职。

2017年5月，新财富杂志发布《2017新财富500富人榜》，潘琦以66.7亿元的财富位列第485名。

2010年10月9日，证监会下达《行政处罚决定书》，对银河集团及实际控制人潘琦等5名责任人给予警告和罚款等处罚。

2011年5月，中国证监会发布对银河投资和潘琦等15人的行政处罚决定书，对银河科技给予警告，并处以50万元罚款，对潘琦等6人分别给予30万罚款。

2011年，银河集团董事长潘琦、董事兼总裁姚国平、副董事长王国生、副总裁龙晓荣、副总裁徐宏军、副总裁顾勇彪、财务总监黄巨芳因银河投资2004年、2005年虚增销售收入、隐瞒对外担保、隐瞒关联交易等行为，受到中国证监会警告和罚款等行政处罚。潘琦被认定为市场禁入者，期限分别为10年。

2019年，潘琦对银河集团在2017年的一宗“合同金额为3亿元，实际发生1.5亿元”的借款提供无限连带责任担保，被出借人指其涉嫌诈骗。